Grupul de Investigaţii Politice, condus de Mugur Ciuvică (GIP) a dat publicităţii înregistrările audio ale unor declaraţii făcute de Traian Băsescu în iunie 1999, într-o situaţie similară celei din cazul Patriciu: anchetarea, timp de mai multe ore şi arestarea prefectului PD de Braşov, Ioan Nicolae Opriş.
     Cu o rapiditate suspectă, Administraţia Prezidenţială a ţinut să dezmintă intenţia lui Băsescu de a se interfera în problemele justiţiei. Mai mult, Traian Băsescu însuşi a intervenit într-o emisiune TV, în direct, acuzând cercuri mafiote care acţionează împotriva sa.
     Documentul GIP susţine că declaraţiile lui Băsescu, făcute atunci, demonstrează că, în momentul în care un apropiat al său a fost arestat pentru corupţie, reacţiile actualului preşedinte, la acea vreme ministru al Transporturilor şi vicepreşedinte PD, au fost mult mai grave decât cele ale lui Călin Popescu-Tăriceanu în cazul Patriciu. Băsescu declara că este "de necrezut ca fie Poliţia, fie Parchetul să nu-şi informeze ministrul de resort: "Domnul ministru, arestăm prefectul!". Actualul preşedinte se declara "îngrozit" că "nimeni din actuala putere" nu a ştiut că prefectul PD va fi arestat, că "nimeni nu mai controlează ce se întâmplă în ţara asta" şi că prefectul a fost arestat "fără ştirea celor care, teoretic, ar trebui să controleze pârghiile". Traian Băsescu spunea că pediştii ar fi trebuit să fie "avertizaţi că va fi arestat prefectul" cu atât mai mult cu cât este vorba despre "un prefect al PD-ului, care, mă rog, e şi la guvernare". Băsescu considera o "premisă elementară" faptul "că nimeni nu-şi putea permite. Poliţia, I.G.P.-ul nu-şi puteau permite aşa ceva, fără să-l informeze pe ministrul de Interne, pe ministrul Justiţiei".
     În 22 iunie 1999, după mai multe ore de anchetă, procurorii Secţiei Anticorupţie, Urmărire Penală şi Criminalistică din cadrul Parchetului de pe lângă Curtea Supremă de Justiţie au dispus arestarea, pentru 30 de zile, prefectului PD de Braşov, Ioan Nicolae Opriş, sub acuzaţia de abuz în serviciu, fals intelectual şi instigare la fals intelectual.
     Opriş era acuzat pentru faptul că, în calitate de reprezentant al FPS în Adunarea Generală a Acţionarilor (AGA) a Fabricii de Zahăr Bod, a emis două procuri prin care l-a împuternicit pe directorul întreprinderii să ipotecheze Secţia "Cicoarea" a Fabricii la Banca Internaţională a Religiilor şi la "Bancorex". Secţia a fost ipotecată în iulie 1998 pentru ca 4 firme private - SC Duplex '91 SRL, SC Edicart SRL, SC Comprod SRL şi SC Euro Metal Production SRL - să obţină împrumuturi bancare de 8,4 miliarde lei, aproximativ 1 milion de dolari la acea dată. Cele 4 firme aparţineau controversatului om de afaceri Petrică Hogea, finul lui Vasile Bran, la acea vreme deputat PD şi a lui Victor Babiuc, la acea vreme ministrul PD al Apărării. Banii nu au mai fost returnaţi băncilor, Fabrica de Zahăr pierzând Secţia "Cicoarea".
     Deşi, în urma scandalului, Opriş a fost exclus din PD şi schimbat din funcţia de prefect, Băsescu şi alţi lideri ai partidului au intervenit în favoarea lui. Urmare a presiunilor politice, Ministerul de Interne a dat publicităţii, în 26 iunie 1999, un comunicat referitor la arestarea fostului prefect. Potrivit acestuia, "nu au existat nici un fel de până la emiterea mandatului de arestare. După emiterea acestuia însă, da!".
     În 13 septembrie 2004, în primul discurs ţinut după ce a fost ales preşedinte, Traian Băsescu spunea: "Nu este permis amestecul politicului în Justiţie, Poliţie, Parchet". În 3 iulie 2005, preşedintele le spunea magistraţilor prezenţi la ceremonia organizată cu prilejul Zilei Justiţiei că "nici un politician nu-şi mai permite să sune la vreun şef de instanţă, la vreun şef de Parchet, indiferent pe ce nivel al ierarhiei".
     Traian Băsescu a criticat, în mai multe rânduri, modul în care liberalii au reacţionat la reţinerea lui Dinu Patriciu. În mai 2005, un comunicat al Administraţiei Prezidenţiale atrăgea atenţia: "Dacă, atunci când organele statului vor încerca să se atingă de corupţie, împotriva lor se vor ridica partide, comunităţi de afaceri, mijloace media, zădărnicind şi intimidând acţiunile legale ale statului, cu certitudine integrarea în UE va rămâne doar un deziderat şi nu o realitate". Atunci însă când un apropiat al său a fost reţinut pentru fapte de corupţie, acelaşi Băsescu se declara "îngrozit" de faptul că puterea politică, din care făcea parte, nu controlează justiţia, conchide documentul GIP.

     "Şi nu puteam să mergem pe logica arestării unui prefect fără ca nici unul din noi să nu ştie nimic, în timp ce nici un ministru de resort nu ştie nimic. Nu puteam să mergem pe altă logică decât că comanda politică s-a dat din altă parte. Din păcate. Nu ştim, bine, rău, dar avem obligaţia să încercăm să ne apărăm, după părerea mea, faţă de ce se întâmplă. Puteam să fim avertizaţi că va fi arestat prefectul, ni-l schimbam din vreme, puteam să ştim de ce", spunea Băsescu în '99, adăugând:
     "Atunci înseamnă că se-ntâmplă altceva extrem de grav. Deci, ministrul de Interne nu ştie, primul ministru nu ştie. Aici s-a făcut o demonstraţie. Noi n-am crezut şi nu putem, ne e greu să credem că nimeni nu mai controlează ce se întâmplă în ţara asta. Dar ştiţi ce m-ar îngrozi, sub cuvânt de onoare? Dacă, într-adevăr, nimeni din actuala putere n-a ştiut". "Venim în partea cealaltă şi spunem: S-a dat o lovitură, care în mod cert PD-ul o pune în spatele celor care au pârghiile astea şi e dată fără ştirea celor care, teoretic, ar trebui să controleze pârghiile".
     "Deci, mie mi-a spus Dudu, zice, băi, Traiane, îţi dau cuvântul meu de onoare că n-am ştiut nimic. Şi atunci am spus, zic, domnule, cine dracu' putea să le ţină spatele pentru aşa o nemernicie, să aresteze un prefect care nu fuge din ţară pentru o chestie de asta? Deci, îl laşi pe PDSR-istul ăla cu 300 de miliarde, cu Mona de Freitas, îl laşi liber, iar pe un prefect al PD-ului, care, mă rog, e şi la guvernare şi colegial, ni s-a părut strigător la cer să nu ne dea cineva un semnal: Bă, vedeţi că-l arestăm! Deci, mi s-a părut de necrezut ca fie Poliţia, fie Parchetul să nu-şi informeze ministrul de resort. Domnule ministru, arestăm prefectul!"
     "Dacă stăm atât de prost încât arestarea unui prefect nu e informată, nu se dă informaţii nici ministrului, nimănui, înseamnă că-i groaznic". Şi sun la Vlad Roşca. Zice, domnule, nici nu ne dă prin cap, zice, habar n-am avut. Vlad Roşca fiind şeful lor, nu? Pe administraţie locală. Sun la Dudu Ionescu, sun la Stoica. Mai mult decât atât, ieri dimineaţă, înainte de şedinţa de Guvern, am vorbit cu amândoi. Mă, spuneţi-ne dacă ştiaţi! Sub cuvânt de onoare, se jură că nu ştiau. Înseamnă că lucrurile ne-au scăpat de sub control". "Deci, în situaţia asta ne trezim. Deci, azi ne-a luat un prefect, mâine ne ia un ministru, domnule". (Fragmente din înregistrarea aflată în posesia lui Mugur Ciuvică)